陈思和于是提议设一所研究院作为专业人才培养的载体。时任复旦大学校长、中国科学院院士杨玉良，曾担任国务院学位办主任，一看到这份方案，便意识到此事的重要性——在当时的学科布局中，还无人做古籍保护。“复旦大学有道义、有责任帮助国家做好古籍保护工作。”经慎重商议，杨玉良破例兼任中华古籍保护研究院的筹备组组长，后担任院长至今。
不同于传统的“修补图书”观念，复旦古保院创造性地融入了科学研究思想，大大拓展古籍保护的内涵。复旦古保院汇集文理各专业学科人才，首创领域内交叉研究模式，培养国家急需的古籍保护高端人才，推动纸质文物保护学术交流与国际合作。研究院整合复旦大学图书馆、高分子科学系、化学系、生命科学学院、文物与博物馆学系、古籍整理研究所、中国历史地理研究所、中文系、出土文献与古文字研究中心等院系的学术力量，共同组建学科平台。
身为高分子科学家，杨玉良曾带领复旦大学跨学科团队通过科研攻关，进行纸张开发，成功“复活”了失传百年的开化纸，保存寿命可达千年以上。此外，团队还在造纸原料荛花植物分布、基因快繁培育方面取得了突破性进展。借鉴开化纸的成功经验，海南沉香纸、山西桑皮纸、延安马兰纸，这些独具地方特色又能长久保存的中国传统纸张，都在陆续“复活”的路上。
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